زندگی آیت الله خامنه ای زندگی ای ساده و روشن است .ايشان در زمان ریاست جمهوری با خانواده تا مدتها در يك اتاق درون مجموعه اداري زندگي مي‌‌‌كردند. همسر رئيس جمهور وقتي از خانه بيرون مي‌‌‌آمدند در واقع وارد قسمت اداري مي‌شدند. حتي بعد كه رياست جمهوري به ساختمان سفيد منتقل شد، ايشان در اتاقي چسبيده به دفترشان زندگي مي‌كردند و فرزندان آقا واقعا حالت زنداني داشتند؛ اما بعدها يعني 4سال پس از شروع رياست جمهوري پشت ساختمان نخست وزير خانه ای به مساحت حدود 100 مترمربع پيش‌بيني شد كه  رئيس جمهور  در آن زندگي مي‌كردند. در زمان رياست جمهوري، حضرت آيت الله خامنه‌اي يك چك پنجاه هزار توماني براي نخست وزير وقت ـ‌ مهندس ميرحسين موسوي ـ‌ ارسال مي‌نمايند و مي‌فرمايند: حداكثر پولي كه ممكن است از بيت المال در هزينه‌هاي شخصي بنده جابجا شده باشد، كمتر از اين است، ولي شما اين مبلغ را به حساب خزانه دولت واريز كنيد تا من مديون بيت المال نباشم